Services & expertises | IRMaGe - Université Grenoble Alpes

L'une de nos missions est de vous apporter un support scientifique et technique. Seules certaines prestations vous seront facturées à un tarif convenu selon la nature de votre projet.

Les informations relatives à la mise en place d'un projet, la tarification, demande de devis et réservation de créneau sont accessibles dans la section Déroulement d'un projet.

Réalisation des projets

Accueil des projets, évaluation des besoins et étude de faisabilité.
Réservation de créneaux en autonomie sur un calendrier en ligne.
Accueil des sujets ou des patients hospitalisés CHUGA directement sur la plateforme.

Méthodologie et R&D en IRM

Adaptation de séquences existantes aux besoins de l'étude.
Développements et tests sur différentes techniques d'imagerie et spectroscopie
Veille scientifique

Support expérimental

Support et évaluation lors de la mise en place des paradigmes expérimentaux.
Conseils méthodologiques.
Mise à disposition des différents équipements de la plateforme et aide à l'usage.

Acquisition des données

Formation à l'acquisition en IRM adaptée à vos usages.
Étude clinique dédiée aux tests sur sujets pilotes (frais DRCI à votre charge).

Prestations sur devis :

Acquisition des données IRM
- avec ou sans aide d'un membre de l'équipe.
- tarification variable selon le type d'expérience (méthodologie, étude clinique, échantillon...).
Anonymisation et transfert de données.
Coordination avec le PACS hospitalier et interprétation médicale.

Traitement de données

Support pour votre projet :

Conversion et formatage des données (format BIDS).
Contrôle qualité (MRIQC avec proposition de guide de contrôle qualité).
Utilisation de logiciels de référence (fMRIPrep, QSIPrep, MRTrix, SPM…).
Traitement des données pilotes pour valider les données.

Les étapes sont à définir en amont en la réalisation du pilote.

Mise à disposition de ressources sur le traitement :

Un site qui regroupe des informations utiles sur le traitement : https://irmage-tools-resources.readthedocs.io
Partage de codes utiles pour des données Phillips et pour des traitements de données : https://github.com/IRMaGe-3T/ et https://gricad-gitlab.univ-grenoble-alpes.fr/irmage/

Intégration de pipeline dans POPULSE MIA :

La plateforme développe actuellement le projet POPULSE (https://populse.github.io/) en collaboration avec Neurospin (CEA, Paris - Saclay). Le but de ce projet est de développer et de proposer à la communauté des outils de traitement de données IRM, dont MIA, pour automatiser les traitements.
Sur demande et sur devis, il est possible d'intégrer des pipelines automatisés de traitement dans MIA (https://github.com/populse/mia_processes).

Traitement des données globales d'une étude :

Le traitement des données globales d'une étude est possible, sur devis.